MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Escherichia coli UMN026 plasmid p1ESCUM

Total Repeats: 2586

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011749	AC	3	6	10	15	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011749	CAGG	2	8	44	51	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011749	A	6	6	83	88	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011749	GTC	2	6	109	114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218692795
5	NC_011749	TGACAC	2	12	126	137	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	218692795
6	NC_011749	AAC	2	6	146	151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218692795
7	NC_011749	TACC	2	8	192	199	25 %	25 %	0 %	50 %	218692795
8	NC_011749	GAA	2	6	211	216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218692795
9	NC_011749	A	8	8	221	228	100 %	0 %	0 %	0 %	218692795
10	NC_011749	GAA	2	6	254	259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218692795
11	NC_011749	TGGATA	2	12	324	335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218692795
12	NC_011749	TGGG	2	8	350	357	0 %	25 %	75 %	0 %	218692795
13	NC_011749	TCAT	2	8	360	367	25 %	50 %	0 %	25 %	218692795
14	NC_011749	TG	3	6	432	437	0 %	50 %	50 %	0 %	218692795
15	NC_011749	TCA	2	6	455	460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218692795
16	NC_011749	CTA	2	6	580	585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218692795
17	NC_011749	CTT	2	6	662	667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218692795
18	NC_011749	AG	3	6	730	735	50 %	0 %	50 %	0 %	218692795
19	NC_011749	TTC	2	6	899	904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218692795
20	NC_011749	ATG	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218692795
21	NC_011749	A	6	6	984	989	100 %	0 %	0 %	0 %	218692795
22	NC_011749	AG	3	6	1099	1104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011749	AGTG	2	8	1140	1147	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011749	CTG	2	6	1178	1183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011749	CTGT	2	8	1186	1193	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011749	TTATG	2	10	1267	1276	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011749	TA	3	6	1298	1303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011749	GCA	2	6	1355	1360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692796
29	NC_011749	CCAG	2	8	1457	1464	25 %	0 %	25 %	50 %	218692796
30	NC_011749	TCG	2	6	1613	1618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218692796
31	NC_011749	ACG	3	9	1639	1647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692796
32	NC_011749	GTG	2	6	1655	1660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218692796
33	NC_011749	ATC	2	6	1661	1666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218692796
34	NC_011749	GGCG	2	8	1730	1737	0 %	0 %	75 %	25 %	218692796
35	NC_011749	CGCA	2	8	1747	1754	25 %	0 %	25 %	50 %	218692796
36	NC_011749	AGA	2	6	1896	1901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218692796
37	NC_011749	CACT	2	8	1908	1915	25 %	25 %	0 %	50 %	218692796
38	NC_011749	CAG	2	6	1924	1929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692796
39	NC_011749	TTC	2	6	1962	1967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218692796
40	NC_011749	GC	3	6	2150	2155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011749	TTTG	2	8	2163	2170	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011749	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011749	GCA	2	6	2220	2225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011749	GGC	2	6	2396	2401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011749	ATA	2	6	2425	2430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011749	TAT	2	6	2440	2445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011749	GTTAT	2	10	2446	2455	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011749	CATG	2	8	2465	2472	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011749	ATC	2	6	2528	2533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011749	GAC	2	6	2560	2565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011749	AAAT	2	8	2570	2577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011749	TTAC	2	8	2590	2597	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011749	AAT	2	6	2598	2603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011749	GAG	2	6	2660	2665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011749	TAA	2	6	2681	2686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011749	T	6	6	2698	2703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011749	CT	3	6	2707	2712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011749	TAT	2	6	2787	2792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218692797
59	NC_011749	GTC	2	6	2831	2836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218692797
60	NC_011749	TGATG	2	10	2859	2868	20 %	40 %	40 %	0 %	218692797
61	NC_011749	TGT	2	6	2896	2901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218692797
62	NC_011749	ATTTTT	2	12	2929	2940	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	218692797
63	NC_011749	T	8	8	2936	2943	0 %	100 %	0 %	0 %	218692797
64	NC_011749	T	7	7	2952	2958	0 %	100 %	0 %	0 %	218692797
65	NC_011749	A	6	6	2985	2990	100 %	0 %	0 %	0 %	218692797
66	NC_011749	T	6	6	3021	3026	0 %	100 %	0 %	0 %	218692797
67	NC_011749	ATG	2	6	3034	3039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218692797
68	NC_011749	TA	3	6	3066	3071	50 %	50 %	0 %	0 %	218692797
69	NC_011749	CTGG	2	8	3119	3126	0 %	25 %	50 %	25 %	218692797
70	NC_011749	GTT	2	6	3157	3162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218692797
71	NC_011749	ATA	2	6	3172	3177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218692797
72	NC_011749	ATA	2	6	3215	3220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218692797
73	NC_011749	ATCT	2	8	3247	3254	25 %	50 %	0 %	25 %	218692797
74	NC_011749	ATTTT	2	10	3386	3395	20 %	80 %	0 %	0 %	218692797
75	NC_011749	TGA	2	6	3488	3493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218692797
76	NC_011749	TAT	2	6	3494	3499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218692797
77	NC_011749	TTA	2	6	3551	3556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218692797
78	NC_011749	ATT	2	6	3595	3600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218692797
79	NC_011749	GGA	2	6	3618	3623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218692797
80	NC_011749	T	7	7	3625	3631	0 %	100 %	0 %	0 %	218692797
81	NC_011749	A	8	8	3649	3656	100 %	0 %	0 %	0 %	218692797
82	NC_011749	GAA	2	6	3807	3812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218692797
83	NC_011749	GAA	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218692797
84	NC_011749	GCA	2	6	3826	3831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692797
85	NC_011749	ACTTG	2	10	3971	3980	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_011749	ATT	2	6	4028	4033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011749	TGA	2	6	4054	4059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011749	AT	3	6	4066	4071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011749	AT	3	6	4118	4123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011749	ACC	2	6	4125	4130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_011749	TAA	2	6	4211	4216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011749	ATTT	2	8	4235	4242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011749	CA	3	6	4324	4329	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_011749	AT	3	6	4341	4346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011749	AC	3	6	4397	4402	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_011749	CATC	2	8	4407	4414	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_011749	A	6	6	4445	4450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011749	ATGA	2	8	4479	4486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011749	AGA	2	6	4490	4495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011749	ATA	2	6	4537	4542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011749	AATG	2	8	4566	4573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011749	TAA	2	6	4591	4596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011749	ATG	2	6	4618	4623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011749	TAT	2	6	4653	4658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011749	TG	3	6	4791	4796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011749	TAGTT	2	10	4799	4808	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011749	T	7	7	4807	4813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011749	ATG	2	6	4904	4909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011749	T	8	8	4910	4917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011749	AT	3	6	5024	5029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011749	ATAGA	2	10	5063	5072	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011749	AGTA	2	8	5088	5095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011749	TAG	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011749	TA	3	6	5121	5126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011749	ATA	2	6	5143	5148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011749	TGT	2	6	5164	5169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011749	GTT	2	6	5180	5185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011749	ATA	2	6	5210	5215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011749	AAC	2	6	5219	5224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011749	ACC	2	6	5247	5252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_011749	TA	3	6	5293	5298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011749	CTG	2	6	5308	5313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011749	AAAT	2	8	5344	5351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011749	AT	3	6	5357	5362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011749	CCT	2	6	5402	5407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_011749	ATC	2	6	5468	5473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011749	T	6	6	5664	5669	0 %	100 %	0 %	0 %	218692798
128	NC_011749	CTT	2	6	5689	5694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218692798
129	NC_011749	T	7	7	5716	5722	0 %	100 %	0 %	0 %	218692798
130	NC_011749	GCA	3	9	5760	5768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692798
131	NC_011749	CAG	2	6	5806	5811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692798
132	NC_011749	CCT	2	6	5821	5826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218692798
133	NC_011749	TTGC	2	8	5831	5838	0 %	50 %	25 %	25 %	218692798
134	NC_011749	CTGG	2	8	5852	5859	0 %	25 %	50 %	25 %	218692798
135	NC_011749	CAA	2	6	5881	5886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218692798
136	NC_011749	CTG	2	6	5915	5920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218692798
137	NC_011749	GTA	2	6	5943	5948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218692798
138	NC_011749	ATCA	2	8	5978	5985	50 %	25 %	0 %	25 %	218692798
139	NC_011749	TAA	2	6	6220	6225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011749	AT	3	6	6256	6261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011749	TTC	2	6	6345	6350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218692799
142	NC_011749	GTC	2	6	6427	6432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218692799
143	NC_011749	GGAC	2	8	6517	6524	25 %	0 %	50 %	25 %	218692799
144	NC_011749	CTTGTT	2	12	6571	6582	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218692799
145	NC_011749	GCA	2	6	6736	6741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692799
146	NC_011749	C	6	6	6751	6756	0 %	0 %	0 %	100 %	218692799
147	NC_011749	GA	3	6	6758	6763	50 %	0 %	50 %	0 %	218692799
148	NC_011749	GTG	2	6	6797	6802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218692799
149	NC_011749	CACAG	2	10	6805	6814	40 %	0 %	20 %	40 %	218692799
150	NC_011749	GC	3	6	6912	6917	0 %	0 %	50 %	50 %	218692799
151	NC_011749	ACAG	2	8	6970	6977	50 %	0 %	25 %	25 %	218692799
152	NC_011749	TCA	2	6	7133	7138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218692799
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154	NC_011749	ACA	2	6	7214	7219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218692799
155	NC_011749	TGT	2	6	7236	7241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218692799
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173	NC_011749	GGCT	2	8	8070	8077	0 %	25 %	50 %	25 %	218692799
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177	NC_011749	GCAA	2	8	8500	8507	50 %	0 %	25 %	25 %	218692800
178	NC_011749	AT	3	6	8532	8537	50 %	50 %	0 %	0 %	218692800
179	NC_011749	ATG	2	6	8600	8605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218692800
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255	NC_011749	CGG	2	6	12423	12428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218692805
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257	NC_011749	CAG	2	6	12527	12532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218692805
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274	NC_011749	CGAG	2	8	13292	13299	25 %	0 %	50 %	25 %	218692807
275	NC_011749	ATTTTG	2	12	13340	13351	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	218692807
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281	NC_011749	ATAC	2	8	13630	13637	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
282	NC_011749	ATG	2	6	13776	13781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_011749	GAC	2	6	13793	13798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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408	NC_011749	CGT	2	6	20802	20807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218692810
409	NC_011749	TAC	2	6	20948	20953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218692810
410	NC_011749	GTC	2	6	21040	21045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218692810
411	NC_011749	T	6	6	21087	21092	0 %	100 %	0 %	0 %	218692810
412	NC_011749	T	6	6	21104	21109	0 %	100 %	0 %	0 %	218692810
413	NC_011749	AAT	2	6	21145	21150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218692810
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415	NC_011749	ATTA	2	8	21235	21242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
416	NC_011749	T	7	7	21262	21268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
417	NC_011749	AAATT	2	10	21310	21319	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_011749	AAT	2	6	22861	22866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218692812
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453	NC_011749	AT	3	6	23040	23045	50 %	50 %	0 %	0 %	218692812
454	NC_011749	ATTA	2	8	23059	23066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_011749	GAAT	2	8	23082	23089	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_011749	G	6	6	23350	23355	0 %	0 %	100 %	0 %	218692813
463	NC_011749	ACGT	2	8	23376	23383	25 %	25 %	25 %	25 %	218692813
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471	NC_011749	GTTT	2	8	24033	24040	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
472	NC_011749	TACAC	2	10	24051	24060	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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482	NC_011749	A	7	7	24562	24568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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